Muse Dash contient actuellement 5 stages jouables, dont un exclusif au DLC. Chaque stage possède des ennemis et un boss uniques à l'exception du Punching Bag qui est toujours de la même couleur, les fantômes et les notes longues sont soit rose ou bleu en fonction de la direction dont ils proviennent. Pour chaque stage, les ennemis colorés en bleu sont aériens et les roses sont terriens. Tout les ennemis se deplacent sur une ligne droite à l'exception des raiders qui sautent sur le stage et des marteaux qui se balancent par le haut.
Candyland[]
Candyland
Space Station[]
Space Station
Castle[]
Castle
Rainy Night[]
Rainy Night
Oriental[]
Oriental
Table de score[]
NOTE : Le score de base et le gain de jauge de Fever se base sur un "Perfect".
NOTE : Bunny Girl Rin obtient 200% plus de scores quand elle collecte les cœurs rouges (en étant PV max) et les notes, repousse les fantômes, et esquive les barrières.
NOTE : Maid Marija gagne 150% plus de PV et est invincible pendant 2 secondes quand elle collecte un cœur rouge en ayant moins de 100 PV.
NOTE : L'Elfin Thanatos procurera 2 secondes d’invincibilité après chaque coup subit ou cœur récupéré.